১৯০৬ সনে অখণ্ড ভারতের রাজস্ব বোর্ডের সদস্য স্যার কৃষ্ণ গোবিন্দ গুপ্ত-র বেঙ্গল ফিশারিজ প্রতিষ্ঠার সম্ভাবনা সম্পর্কে পরিচালিত সমীক্ষার সুপারিশক্রমে ১৯০৮ সনে মৎস্য পরিদপ্তর প্রতিষ্ঠিত হয়। মৎস্য পরিদপ্তর বিগত ১৯১০ সনে কৃষি অধিদপ্তরের সাথে একীভূত হয়। পরবর্তীতে এ পরিদপ্তর ১৯২৭ সনে বিলুপ্ত করা হয় এবং আবার ১৯৩৭ সনে পুনঃপ্রতিষ্ঠিত হয়। ১৯৮৩ সনে পরিদপ্তর মৎস্য অধিদপ্তরে উন্নীত হয়।
মাছ ও চিংড়িসহ অন্যান্য জলজ সম্পদের স্থায়িত্বশীল উৎপাদন বৃদ্ধি করে দেশের জনগণের পুষ্টি চাহিদা পূরণ ও রপ্তানি আয় বৃদ্ধি এবং অভীষ্ট জনগোষ্ঠীর অংশগ্রহণে উন্মুক্ত জলাশয়ের সুষ্ঠ ব্যবস্থাপনার মাধ্যমে এ ক্ষেত্র হতে প্রাপ্ত সুফলের মাধ্যমে দরিদ্র মৎস্যজীবী ও মৎস্যচাষি, তথা বাংলাদেশের আর্থ-সামাজিক ক্ষেত্রে কাঙ্ক্ষিত উন্নয়ন সাধন মৎস্য অধিদপ্তরের উদ্দেশ্য।
সিনিয়র উপজেলা মৎস্য কর্মকর্তার কার্যালয় মৎস্য ও প্রাণিসম্পদ মন্ত্রণালয়ের অধীন মৎস্য অধিদপ্তরের সিনিয়র উপজেলা পর্যায়ের অফিস।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস